Num dos lançamentos de atualização de firmware, se não me engano, da EOS 50D, lembro de ter vistal algo relacionado a um funcionamento ruim do flash externo. Eu não notei acontecer com a minha câmera (tive uma 50D) e com o meu flash externo, mas usava pouco o flash.Eu atualizei o firmware e a amiga para quem eu dei a câmera depois que comprei uma nova nunca notou nada.
Existe a possibilidade de estar com configuração do flash externo (personalizações feitas pelo menu da câmera) diferentes para ambas as câmeras que usou com o mesmo flash?
Será que na 700D não está a utilizar o flash no modo de ser master para controle remoto (esta função não existe na 1200D) de outro flash? Isso pode fazer a bateria consumir mais rápido, se nota esse uso pela luz vermelha piscante no flash.
Qual é o seu flash? Fiz uma busca no Google para ver se existia algum relato parecido, mas não encontrei, talvez colocando o modelo do flahs a busca seja mais eficiente.